Vào ngày 24/10, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã ra Quyết định khởi tố bị can, Lệnh khám xét với 9 bị can.
Có 3 bị can gồm: Dương Tuấn Minh, nguyên Tổng giám đốc, Dương Thị Trâm Anh, nguyên Phó tổng giám đốc và Nguyễn Thu Trang, nguyên Phó phòng Đầu tư và Quản lý đấu thầu Tổng công ty Cửu Long bị khởi tố về tội Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí theo khoản 3, Điều 219, Bộ luật Hình sự 2015.
Có 6 bị can gồm Tạ Đức Minh, Phạm Tấn Hoàng và Đinh Thị Chung, nhân viên Công ty cổ phần Tập đoàn Yên Khánh và Đinh Ngọc Hệ, Phạm Văn Diệt (nguyên giám đốc điều hành) và Vũ Thị Hoan (nguyên Tổng giám đố CTCP Tập đoàn Yên Khánh) về tội Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng theo khoản 3, Điều 221, Bộ luật Hình sự 2015.
Sau khi VKSND tối cao phê chuẩn các Quyết định và Lệnh, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã thi hành các Quyết định và Lệnh nêu trên đúng quy định pháp luật.
Hiện Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đang tiếp tục điều tra triệt để, mở rộng vụ án và áp dụng các biện pháp theo luật định để thu hồi tài sản cho Nhà nước.
Trước đó, Báo Đầu tư Chứng khoán đã phản ánh về tranh chấp thanh toán hợp đồng bán quyền thu phí sử dụng đường bộ trên tuyến cao tốc TPHCM – Trung Lương giai đoạn 1 giữa 2 doanh nghiệp này.
Theo đó, cuối năm 2013, thực hiện nhiệm vụ được Bộ GTVT giao, Tổng công ty Cửu Long ký hợp đồng mua bán quyền thu phí với Công ty Yên Khánh. Công ty Yên Khánh phải thanh toán số tiền 2.004 tỷ đồng để được quyền thu phí tại 4 trạm trong thời hạn 5 năm (từ năm 2014-2019). Ngân hàng BIDV phát hành chứng thư bảo lãnh cho Công ty Yên Khánh, trị giá 100,2 tỷ đồng.
Quá trình thực hiện, hai bên phát sinh tranh chấp về khoản tiền lãi chậm thanh toán, tiền thuế GTGT và tiền đền bù thiệt hại do thi công hệ thống giao thông thông minh (ITS).
Cuối tháng 7/2019, Tòa án nhân dân Cấp cao tại TPHCM buộc Công ty Yên Khánh phải thanh toán cho Công ty Cửu Long số tiền chậm thanh toán là hơn 262 tỷ đồng. Ngân hàng liên đới phải thanh toán cho Công ty Cửu Long số tiền 100,2 tỷ đồng.
