Theo đó, sẽ có 3 dự án đang chuẩn bị đầu tư, 2 dự án đang thực hiện đầu tư do Cục Đường sắt Việt Nam làm chủ đầu tư; 6 dự án đang chuẩn bị đầu tư, 7 dự án thực hiện đầu tư do Tổng công ty Đường sắt Việt Nam làm chủ đầu tư sẽ được đưa về Bộ GTVT quản lý. Trong số này, có những dự án quy mô lớn như đường sắt đô thị Cát Linh - Hà Đông (ODA Trung Quốc); đường sắt đô thị TP. Hà Nội tuyến số 1, số 2, nâng cao an toàn cầu đường sắt (ODA Nhật Bản)…
Bộ GTVT dự kiến sáp nhập Ban quản lý dự án đường sắt (thuộc Cục Đường sắt) và Ban quản lý các dự án đường sắt (thuộc Tổng công ty Đường sắt) và chuyển ban này về trực thuộc Bộ GTVT.
