Hoạt động sản xuất, kinh doanh chính của Navico là chế biến, xuất khẩu các sản phẩm từ cá tra, cá basa (thịt cá tra, cá basa phi lê; da cá, đầu xương cá, bao tử cá, bột cá, dầu mỡ thành phẩm cá tra, basa...) cùng một số sản phẩm từ các loại thuỷ sản khác.
Hiện Navico có 3 nhà máy chế biến cá tra, 1 nhà máy chế biến dầu cá, bột cá và 1 nhà máy sản xuất bao bì. Tổng công suất chế biến của Công ty là 1.300 tấn cá nguyên liệu/ngày.
Năm 2004, lợi nhuận sau thuế của Công ty đạt 46,6 tỷ đồng; năm 2005 đạt 72,4 tỷ đồng; năm 2006 đạt 270 tỷ đồng. 4 tháng đầu năm 2007, lợi nhuận sau thuế của Navico đạt 169 tỷ đồng. Trong năm 2007, Navico dự kiến đạt kim ngạch xuất khẩu 200 triệu USD; mở rộng thị trường xuất khẩu sang 60 nước; lợi nhuận đạt 450 tỷ đồng; cổ tức ở mức 20% trong năm 2007, 22% trong năm 2008 và 25% trong năm 2009.
