Theo đó, các dự án có quy mô lớn, từ 500 triệu USD trở lên, hoặc dự án có ý nghĩa kinh tế - xã hội đặc biệt quan trọng, Ban Quản lý Khu kinh tế mở Chu Lai có trách nhiệm xem xét tham mưu UBND tỉnh đề xuất với các bộ, ngành Trung ương về cơ chế ưu đãi đầu tư vượt trội.
Các dự án còn lại được hưởng chính sách ưu đãi áp dụng đối với địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn theo quy định của Chính phủ về đầu tư, đất đai, thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế thu nhập cá nhân... Chẳng hạn, được hưởng thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp 10% trong thời gian 15 năm; miễn 4 năm và giảm 50% trong 9 năm tiếp theo. Với các dự án cần thu hút đầu tư có quy mô lớn và công nghệ cao, thì thời gian áp dụng thuế suất ưu đãi có thể kéo dài hơn, nhưng thời gian kéo dài thêm không quá 15 năm.