Bepharco được thành lập theo Quyết định số 1541/QĐ-UB ngày 6/5/2004 của UBND tỉnh Bến Tre về việc chuyển Công ty Dược và Vật tư Bến Tre thành CTCP Dược phẩm Bến Tre, vốn điều lệ 20 tỷ đồng; đến tháng 11/2007, Bepharco phát hành thêm 1 triệu cổ phiếu tăng vốn điều lệ lên 30 tỷ đồng.
Bepharco có ngành nghề chính là sản xuất - kinh doanh thuốc trị bệnh; thực phẩm chức năng; nước uống đóng chai, thùng; kinh doanh các loại máy móc, trang thiết bị y tế; cho thuê mặt bằng, kho bãi; xuất nhập khẩu các mặt hàng: thuốc thành phẩm, bao bì, nguyên phụ liệu, hương liệu phục vụ sản xuất, hóa chất xét nghiệm, sản phẩm sinh học…
Hiện nay, Bepharco đã phát triển được các chi nhánh ở 5 thành phố lớn: Hà Nội, TP. HCM, Đà Nẵng, Cần Thơ, Khánh Hòa và gần 500 đại lý, cửa hàng trên toàn quốc. Chín tháng đầu năm, Công ty đạt tổng doanh thu hơn 303 tỷ đồng; lợi nhuận trước thuế hơn 6 tỷ đồng.