Theo cáo trạng được đại diện Viện Kiểm sát công bố tại phiên tòa, CTCP Tập đoàn An Phú là của Trần Duy Tùng, nhờ Trần Anh Quang (cháu ông Trần Bắc Hà, đã bị bắt về tội Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản) và Thái Thành Vinh đứng tên tham gia góp vốn. Trần Anh Quang giữ chức vụ Chủ tịch HĐQT giúp Tùng.
Tập đoàn An Phú được cấp giấy chứng nhận đầu tư ra nước ngoài để thành lập liên doanh Công ty SHH Viêng Chăn với số vốn đầu tư ra nước ngoài là hơn 13,4 triệu USD (hơn 293 tỷ đồng, tương đương 49% vốn điều lệ).
Đối tác phía Lào là Công ty Outhid Houng Heung.
Theo báo cáo của Trần Anh Quang – Chủ tịch HĐQT Tập đoàn An Phú và ông Oudomsup Senmysouk, Tổng giám đốc Công ty Outhid Houng Heung, ngày 23/12/2015, Tập đoàn An Phú đã chuyển sang Lào 4 triệu USD từ tài khoản công ty mở tại Ngân hàng Nhà nước chi nhánh Bình Định.
Thực chất, từ năm 2013 – 2015, Trần Duy Tùng và Thái Thành Vinh đã nộp 10,4 triệu USD tiền mặt vào tài khoản của Thái Thành Vinh mở tại LaoVietBank. Sau đó, sử dụng tiền từ nguồn này để thông qua Công ty Outhid Houng Heung góp vốn vào tài khoản của LaoVietBank với tỷ lệ 10%.
Toàn bộ số tiền 10 triệu USD, ông Oudomsup Senmysouk xác nhận là tiền của Trần Duy Tùng mượn danh nghĩa công ty để tham gia góp vốn vào Công ty SHH Viêng Chăn, để góp vốn vào LaoVietBank.
Khi LaoVietBank trả cổ tức (hơn 2,3 triệu USD), số tiền được trả cho Công ty SHH Viêng Chăn nhưng Trần Duy Tùng mới là người quản lý sử dụng cá nhân, không chuyển về nước theo quy định tại Luật Đầu tư 2014.
Cơ quan điều tra xác định, việc Tập đoàn An Phú xin cấp giấy chứng nhận đầu tư ra nước ngoài thành lập liên doanh là Công ty SHH Viêng Chăn, thực hiện góp vốn vào LaoVietbank là để hợp thức hoá và che giấu hành vi đầu tư ra nước ngoài trái phép của Trần Duy Tùng, Thái Thành Vinh và Trần Anh Quang. Đồng thời, hợp thức hoá số tiền 10,4 triệu USD tiền mặt Trần Duy Tùng và Thái Thành Vinh đầu tư trái phép sang Lào, nộp gửi tiết kiệm tại LaoVietbank. Sau đó dùng để góp vốn vào LaoVietBank cho Công ty SHH Viêng Chăn thông qua Công ty Outhid Houng Heung.
Hành vi nộp trái phép 10,4 triệu USD của Tùng và Vinh có dấu hiệu của tội “vận chuyển trái phép hàng hoá, tiền tệ qua biên giới” hoặc "rửa tiền".
Hiện Trần Duy Tùng (con trai ông Trần Bắc Hà) và Vinh đã bỏ trốn, chưa lấy lời khai nên Cơ quan điều tra quyết định tách hành vi này ra khỏi vụ án, khi nào bắt được 2 bị can này sẽ điều tra và xử lý.
Thông qua hoạt động tương trợ tư pháp về hình sự, Viện KSND Tối cao Lào phong tỏa ngăn chặn giao dịch 10% vốn góp của Công ty SHH Viêng Chăn tại LaoVietBank để chờ phán quyết của cơ quan có thẩm quyền Việt Nam.