Sau phiên thảo luận, Quốc hội đã dành thời gian cuối giờ chiều 3/11 để tiến hành bỏ phiếu kín bãi nhiệm đại biểu Quốc hội đối với ông Phạm Phú Quốc. Tham dự bỏ phiếu có 471/482. Số phiếu phát ra là 471, số phiếu thu về 471, số phiếu hợp lệ 470, số phiếu không hợp lệ 1. Số phiếu đồng ý 467, (bằng 96,8% tổng số ĐBQH). Số phiếu không đồng ý 3 (0,62% tổng số ĐBQH).
Theo UBTVQH, sự việc ông Phạm Phú Quốc xin nhập quốc tịch Cộng hoà Síp và đã có quốc tịch Cộng hoà Síp nhưng không báo cáo với cơ quan, tổ chức là không trung thực, vi phạm tiêu chuẩn đại biểu Quốc hội theo quy định tại Điều 22, Luật Tổ chức Quốc hội.
Theo UBTVQH, sai phạm của ông Phạm Phú Quốc, là nghiêm trọng, gây ảnh hưởng xấu trong công luận và nhân dân, khiến uy tín của ông Phạm Phú Quốc bị giảm sút. Cử tri, nhân dân, thông qua Uỷ ban Trung ương Mặt trận Tổ quốc Việt Nam bày tỏ sự không tín nhiệm và đề nghị Quốc hội bãi nhiệm đại biểu Phạm Phú Quốc.
Trước đó, báo chí đã thông tin, từ năm 2018, ông Phạm Phú Quốc đã làm thủ tục xin quốc tịch Cộng hoà Síp và đã được cấp hộ chiếu nước này vào ngày 11/2/2019. Tuy nhiên ông Quốc đã không báo cáo với đoàn đại biểu Quốc hội TP.HCM về việc này.
Ông Phạm Phú Quốc, 52 tuổi, quê Quảng Trị, từng giữ các chức vụ Phó viện trưởng Viện Nghiên cứu và phát triển TP.HCM, Tổng giám đốc Công ty Đầu tư tài chính nhà nước TP.HCM (HFIC), Chủ tịch hội đồng thành viên Tổng công ty Bến Thành TNHH MTV.
Ngày 4/12/2019, ông Quốc được UBND TP.HCM bổ nhiệm làm Tổng giám đốc Công ty TNHH MTV Phát triển công nghiệp Tân Thuận (IPC).