Chi nhánh MTS tại Hà Nội có nhiệm vụ thực hiện các giao dịch và thực hiện các hợp đồng nhập khẩu, ủy thác nhập khẩu hàng hóa từ nước ngoài về phục vụ ngành than và các ngành công nghiệp khác.
Từ tháng 5- 11/2001, Phạm Công đại diện cho MTS và Lê Việt Dũng (đại diện của Công ty Đầu tư và Phát triển Hà Nội - Hapexco) đã ký 3 hợp đồng để nhập khẩu phôi thép cho Hapexco.
Quá trình thực hiện các hợp đồng này, ông Ngà đã buông lỏng quản lý như không bắt buộc Hapexco đặt cọc 10% giá trị hợp đồng, không yêu cầu thế chấp 100% hàng hóa, không theo dõi, giám sát hàng hóa; không yêu cầu Hapexco thực hiện đúng thời hạn thanh toán nhưng vẫn tiếp tục ký các hợp đồng ủy thác mới.
Hành vi này dẫn đến việc ông Lê Việt Dũng bán hàng, thu tiền xong không thanh toán đầy đủ.
Những sai phạm của ông Ngà dẫn đến việc ông Lê Việt Dũng chiếm đoạt hơn 62 tỷ đồng của MTS và bỏ trốn sang Mỹ.
Đến tháng 7/2003, ông Lê Việt Dũng mới nộp lại tiền và tài sản trị giá gần 45,5 tỷ đồng để khắc phục hậu quả. Năm 2010, ông Lê Việt Dũng đã chết tại Mỹ.
Hiện nay, thiệt hại còn gần 17 tỷ đồng chưa được khắc phục. MTS yêu cầu bị cáo Phạm Công Ngà có trách nhiệm bồi thường.
Quá trình điều tra, ông Ngà cho rằng, vụ án không có thiệt hại vì số tiền gần 17 tỷ đồng được Hapexco Đà Nẵng trả cho chi nhánh MTS Hà Nội. Tuy nhiên, đến nay chi nhánh Hapexco Đà Nẵng đã bị giải thể năm 2002. Cựu kế toán trưởng công ty không rõ địa chỉ cư trú. Mặt khác, không có tài liệu phản ánh Hapexco Đà Nẵng đã trả thêm tiền.