Tổng công ty này có chức năng tổ chức và giám sát hoạt động đăng ký, lưu ký, bù trừ và thanh toán trên TTCK.
Ngoài ra, về thành viên của Tổng công ty, ngoài thành viên lưu ký, sẽ bổ sung thành viên bù trừ để phù hợp với thực tiễn.
Các đề xuất trên nhằm nâng cao chất lượng hoạt động cung cấp dịch vụ liên quan đến quản lý chứng khoán của nhà đầu tư; từng bước kết nối với các tổ chức lưu ký chứng khoán trong khu vực và trên thế giới.