Theo dự thảo Quỹ phát triển DNNVV có các chức năng huy động, tiếp nhận các nguồn tài chính trong nước; tiếp nhận, quản lý và sử dụng các nguồn tài trợ, viện trợ để thực hiện các hoạt động hỗ trợ phát triển DNNVV. Ngoài ra, Quỹ tài trợ kinh phí cho các chương trình, dự án trợ giúp nâng cao năng lực cạnh tranh; ủy thác cho các tổ chức tín dụng cho vay ưu đãi các DNNVV có dự án đầu tư khả thi thuộc lĩnh vực ưu tiên, khuyến khích của Nhà nước.
Nguồn vốn của Quỹ một phần từ Ngân sách Nhà nước, ngoài ra từ đóng góp của các tổ chức tài chính trong nước; các khoản viện trợ, tài trợ của các tổ chức nước ngoài, các tổ chức quốc tế; từ các hoạt động của Quỹ và các nguồn vốn hợp pháp khác. Bên cạnh đó, Bộ Kế hoạch và Đầu tư cũng sẽ thành lập Trung tâm xúc tiến phát triển DNNVV, thuộc Cục Phát triển DNNVV để làm đầu mối tư vấn và thực hiện thí điểm mô hình trợ giúp các DN này.
Đồng thời, thông qua các chương trình trợ giúp, Chính phủ thực hiện chính sách hỗ trợ các DNNVV trong việc đổi mới, nâng cao năng lực công nghệ, trình độ kỹ thuật; xúc tiến mở rộng thị trường; cung cấp thông tin, tư vấn, đào tạo nguồn nhân lực.
Dự thảo nghị định cũng đề cập việc phân loại DNNVV thành 3 cấp: siêu nhỏ, nhỏ, vừa trong 3 khu vực chính (nông, lâm nghiệp và thủy sản; công nghiệp và xây dựng; thương mại và dịch vụ). Căn cứ phân loại dựa vào 1 trong 2 tiêu chí vốn sản xuất kinh doanh hoặc số lao động bình quân năm, bởi lẽ tiêu chí phân loại DNNVV có vốn dưới 10 tỷ đồng và 300 lao động theo quy định cũ cho đến nay đã không còn phù hợp.
