Cùng bị khởi tố về hành vi trên còn có Vũ Văn Chương (49 tuổi - được tại ngoại), Phó giám đốc và Đặng Minh Quang (47 tuổi), Kế toán trưởng của Công ty Minh Quân.
Theo điều tra, năm 2009, Khanh rủ Chương thành lập Công ty Minh Quân, thu mua nông sản. Khanh và Chương đem tài sản của công ty, thế chấp cho nhiều ngân hàng để vay trên 60 tỉ đồng, trong đó vay Ngân hàng TMCP quốc tế Việt Nam - chi nhánh Đồng Nai (VIB Đồng Nai) 56 tỉ đồng.
Đến kỳ hạn, do không có tiền để đáo hạn (tháng 2/2011), Khanh và Chương lập phương án vay tiếp 78 tỷ đồng tại VIB Đồng Nai. Do tài sản không đủ để thế chấp, Khanh và Chương chỉ đạo Quang mua 2 hóa đơn GTGT khống của Công ty TNHH TM SX Tân Hồng Phước và Công ty TNHH TM DV Bảo Yên (đều đóng tại TP.HCM). Quang điền thêm vào hóa đơn phần hàng hóa giá trị các loại nông sản trên 73 tỷ đồng. Đồng thời, làm giả giấy tờ để hợp thức hóa hồ sơ vay vốn.
Không tiến hành kiểm tra thực tế hàng hóa, VIB đã làm thủ tục giải ngân 60 tỷ đồng cho Công ty Minh Quân. Sau khi vay được số tiền trên, Công ty Minh Quân đã không trả nợ vay trước đó theo quy định.
Tính đến nay, Công ty Minh Quân còn nợ quá hạn tại VIB Đồng Nai số tiền hơn 73 tỷ đồng (sau khi đã khấu trừ tài sản thế chấp).