Tuy nhiên, nếu lựa chọn được một công ty kiểm toán làm đơn vị kiểm toán chung cho tất cả các công ty con thì ưu điểm lớn chính là việc thuận lợi cho quá trình hợp nhất báo cáo tài chính. Trên thực tế, nhiều trường hợp nếu công ty con được kiểm toán bởi một công ty kiểm toán khác thì trong quá trình kiểm toán công ty mẹ, đơn vị kiểm toán có thể phải xem lại kết quả kiểm toán, thậm chí là kiểm toán lại công ty con. Điều này sẽ gây ảnh hưởng đến thời gian và chi phí cho cả công ty kiểm toán và công ty được kiểm toán.
Với việc kiểm toán cho cả tập đoàn, thông thường, doanh thu của công ty kiểm toán từ tập đoàn sẽ lớn. Và tất nhiên, không thể loại trừ khả năng ý kiến kiểm toán viên thiếu tính độc lập do Công ty bị phụ thuộc vào nguồn thu lớn này. Và khi đó, tùy theo từng công ty kiểm toán khác nhau sẽ phải xây dựng "tường lửa" với các quy định khắt khe hơn quy định của nước sở tại để đảm bảo tính khách quan cho các ý kiến kiểm toán. Như với Grant Thornton, khi doanh thu từ một khách hàng chiếm tỷ lệ cao (ví dụ từ 10% tổng doanh thu của Công ty trở lên) thì các ý kiến kiểm toán đưa ra phải được một đơn vị kiểm toán khác (Grant Thornton khác hoặc Grant Thornton International) cùng xem xét hoặc rà soát lại. Bên cạnh đó, các kiểm toán viên nếu có sở hữu cổ phiếu của một công ty (không kể khối lượng bao nhiêu), thì sẽ không được tham gia kiểm toán công ty đó, ngoại trừ việc bán toàn bộ lượng cổ phiếu này trước khi thực hiện kiểm toán.
