Các mục tiêu chủ yếu của Nhiệt điện Phả Lại như sau: Đảm bảo vận hành các tổ máy an toàn, liên tục, kinh tế và tham gia thị trường điện; Sản lượng điện sản xuất hàng năm đạt từ 5,8 tỷ KWh trở lên, doanh thu từ sản xuất điện đạt từ 3.026 tỷ đồng trở lên; Đảm bảo tỷ lệ trả cổ tức tối thiểu đạt từ 12% năm, ổn định và nâng cao đời sống vật chất tinh thần cho người lao động.
Năm 2006, lợi nhuận thực hiện của Nhiệt điện Phả Lại đạt gần 979,34 tỷ đồng, tăng 63,45% so với kế hoạch, lợi nhuận sau thuế/vốn điều lệ là 31,52%, lợi nhuận sau thuế/nguồn vốn chủ sở hữu 26,39%, lợi nhuận sau thuế/doanh thu thuần 27,04%..