Theo kết luận, Công ty THT đã chấp hành đầy đủ các quy định về việc kê khai, nộp thuế. Tuy nhiên còn tồn tại nhiều nội dung.
Về thuế GTGT, Công ty THT sử dụng hóa đơn của doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đăng ký trước thời điểm Cơ quan thuế thông báo không đúng quy định tại Điều 15 Thông tư số 219/2013/TT- BTC ngày 31/12/2013 và Điểm 10, Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC ngày 27/02/2015 của Bộ Tài chính.
Về thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), Công ty THT hạch toán chi phí hóa đơn của doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đăng ký trước thời điểm. Cơ quan thuế thông báo, hạch toán chi phí dở dang không đúng quy định tại Điều 6 Thông tư số 78/2014/TT-BTC ngày 18/6/2014 và Điều 4 Thông tư số 96/2015/TT-BTC của Bộ Tài chính.
Đáng chú ý, qua rà soát hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ theo dữ liệu trên hệ thống quản lý thuế TMS ngày 20/02/2025, Đoàn thanh tra xác định niên độ năm 2023, Công ty TNHH phát triển THT sử dụng 28 số hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của 8 doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký trước thời điểm Cơ quan thuế thông báo, tổng giá trị hàng hóa dịch vụ mua vào 743 triệu đồng, thuế GTGT 72,7 triệu đồng. Công ty TNHH phát triển THT đề nghị điều chỉnh giảm thuế GTGT đầu vào được khấu trừ, chi phí hạch toán trong kỳ và tính phạt theo quy định đối với 28 số hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của doanh nghiệp nêu trên.
Theo đó, tổng số tiền thuế TNDN, GTGT bị truy thu sau thanh tra là 3,44 tỷ đồng, thuế GTGT khấu trừ chuyển kỳ sau giảm 71 triệu đồng.
Cùng với đó, Công ty THT phải nộp tiền phạt là 760 triệu đồng do hành vi khai sai và tiền chậm nộp tính đến ngày 26/2/2025 là 343 triệu đồng.
Tổng số tiền bị truy thu, xử phạt, tiền chậm nộp là 4,5 tỷ đồng.
