Theo cáo trạng, đầu năm 2009, Tân quen biết Nguyễn Mạnh Hà (ở Tuyên Quang) và Bùi Thị Thanh Hà (ở thị xã Sơn Tây, Hà Nội). Tân tự giới thiệu là Chánh Văn phòng Hiệp hội doanh nghiệp vừa và nhỏ, còn Mạnh Hà là cán bộ của ngành ngân hàng. Cả hai khoe quen biết nhiều lãnh đạo các ngành, có khả năng xin việc làm.
Thanh Hà bàn bạc nhờ Tân, Mạnh Hà xin việc cho một số người. Theo sự thỏa thuận giữa ba người, mỗi suất xin việc, Thanh Hà phải có trách nhiệm đưa về cho Tân và Mạnh Hà hồ sơ và tiền theo báo giá.
Cụ thể, trường hợp xin vào công chức giáo viên là 40 triệu đồng, vào Bệnh viện Sơn Tây là 45 triệu đồng, vào ngân hàng 60 triệu đồng, vào Bệnh viện nhi Trung ương là 80 - 85 triệu đồng, vào Bệnh viện Phụ sản 60 - 70 triệu đồng, Bệnh viện 198 là 60 - 70 triệu đồng, hồ sơ xin chuyển vùng là 35 triệu đồng, hồ sơ xin vào ngành Công an 90 triệu đồng, hồ sơ xin vào an ninh sân bay Nội Bài là 60 triệu đồng…
Sau khi thống nhất giá cả, Thanh Hà hứa hẹn với nhiều người chạy việc trong thời gian 1 tháng và tự ý nâng giá cao gấp đôi. Tin tưởng, nhiều người đã gửi hồ sơ xin việc cho Thanh Hà với mong muốn xin việc cho người thân. Từ tháng 6/2009, Thanh Hà nhận 68 bộ hồ sơ cùng gần 3,7 tỷ đồng và sau đó chuyển cho cho Tân và Mạnh Hà. Còn bản thân Thanh Hà “đút túi” tiền chênh lệch, gần 1 tỷ đồng.
Cầm tiền nhưng các đối tượng trên không làm thủ tục xin việc, mà sử dụng tiêu xài cá nhân. Năm 2015, đối tượng Thanh Hà, Mạnh Hà bị xử phạt 12 - 13 năm tù; còn Tân bỏ trốn.
Theo cáo buộc, từ tháng 5-9/2009, Phùng Ngọc Tân trực tiếp nhận 54 hồ sơ xin việc và 2,3 tỷ đồng do Bùi Thị Thanh Hà chuyển đến.