Điểm đáng chú ý của dự thảo là cơ quan, tổ chức, cá nhân có các thông tin, tài liệu, chứng cứ liên quan đến nội dung thanh tra phải cung cấp đầy đủ, kịp thời theo yêu cầu của Thanh tra Uy ban Chứng khoán Nhà nước (UBCK) và phải chịu trách nhiệm về tính chính xác, trung thực của những thông tin, tài liệu và chứng cứ đã cung cấp.
Điểm mới của dự thảo là Thanh tra UBCK được tổ chức theo mô hình thanh tra chuyên ngành, có chức năng tham mưu nhiều hơn, giúp Chủ tịch UBCK tiến hành thanh tra về chứng khoán và TTCK; giải quyết khiếu nại, tố cáo và phòng, chống tham nhũng. Bộ phận thanh tra chuyên ngành chứng khoán được tổ chức thành Vụ Thanh tra với người đứng đầu là Vụ trưởng thay vì Chánh thanh tra như hiện tại.