Trước đó, BMP khiếu nại quyết định truy thu và phạt lên tới 114 tỷ đồng của Cục Thuế TP. HCM lên Tổng cục Thuế.
Theo quyết định của Tổng cục Thuế, BMP vẫn phải nộp 75 tỷ đồng số tiền truy thu thuế, khoản phạt nộp chậm và vi phạm hành chính 42 tỷ đồng được Tổng cục Thuế bãi bỏ. Trường hợp BMP không đồng ý với quyết định giải quyết khiếu nại nói trên, BMP có quyền khởi kiện vụ án hành chính tại tòa án theo quy định của Luật Tố tụng hành chính.
Theo bà Nguyễn Thị Kim Yến, Phó tổng giám đốc BMP, Công ty không đưa vụ việc ra tòa, mà tiếp tục khiếu nại lên các cấp cao hơn, vì doanh nghiệp không làm sai quy định.
Liên quan đến vấn đề này, Thời báo Ngân hàng đưa tin, thay mặt Thủ tướng Chính phủ, Phó Thủ tướng Vũ Văn Ninh chỉ đạo, việc ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp đối với trường hợp niêm yết chứng khoán lần đầu giai đoạn 2004 - 2006 phải thực hiện theo đúng quy định của pháp luật và chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ tại Công văn số 794/VPCP-KTTH ngày 29/1/2014. Tuy nhiên, để xử lý khó khăn, vướng mắc như báo cáo của Bộ Tài chính tại Công văn số 7817/BTC-TCT ngày 12/6/2014, Phó Thủ tướng đồng ý về nguyên tắc thực hiện truy thu số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp sau khi trừ đi phần lãi hoặc cổ tức đã chia cho đại diện vốn nhà nước tại doanh nghiệp.
